原作・福井晴敏のインタビューを本編前にお届け！自衛隊のある消えた中隊を追って捜索部隊は、戦国時代の1549年にタイムトラベルする超一級のスペクタクル・アクション。
2003年。陸上自衛隊東富士駐屯地で人工磁場シールドの実験中、装置の暴走事故が起き、実験に参加した的場1佐らの中隊が消失してしまう。2年後、中隊はどうやら456年前の戦国時代にタイムスリップしたらしいと分かり、的場の元部下で今は民間人である鹿島らが事態収拾のための捜索部隊に選ばれ、1549年に送り込まれる。鹿島らは、自衛隊の軍事力を使って1549年の日本を支配しようとしている的場ら中隊と対峙する。