伝説的TVアニメの劇場版。極秘文書に記された主人公キリコの正体とは？本編前後では、平野文のナレーションによる解説や高橋良輔監督のインタビューをお送りします。
レッドショルダー隊を除隊になったキリコは、新たに惑星ロウムスでの任務に就くことになった。彼の配属された小隊には、次々と過酷な任務が課せられるが、その裏には軍情報省次官ウォッカムの思惑が隠されていた。レッドショルダー隊の元司令官であるペールゼンの手になる秘密文書、ペールゼン・ファイルズを手に入れたウォッカムは、ペールゼンを拷問にかけて暗号を解き明かし、キリコらに関する秘密の一端をつかんでいたが……。