世界中で数百万の人々が突如消失するという未曽有の非常事態が発生する中、必死にその危機に立ち向かうパイロットをニコラス・ケイジが熱演した怪作パニックサスペンス。
父親レイの誕生日を家族と祝うべく、帰省した女子大学生のクローイ。だがパイロットであるレイがあいにく仕事で欠席すると知ったクローイは、NYの空港に向かう。そこで彼女は人気TVリポーターのバックと偶然知り合う一方、離陸寸前の父親を捕まえて会話を交わす。やがてレイは旅客機を操縦してロンドンに出発するが、上空で突如、機内から多くの乗客が消失する事態が。同じころ、地上でも至る所で同様の異変が起きていて……。