綾瀬はるかが主演したハードボイルドアクション。長浦京が第19回大藪春彦賞に輝いた小説を映画化。大正時代末期、かつて“リリー”と呼ばれるスパイだった女性は激闘へ。
関東大震災の翌年の1924年、東京・墨田区。あるカフェーで女将をしている百合は、かつて任務のためには殺人もいとわない非情のスパイ、“リボルバー・リリー”として活躍した。そんな百合はある一家が殺された事件で自身の旧知の男性が疑われていると知り、男性の家がある秩父へ。その帰途の列車で男性の13歳の息子・慎太と出会い、軍人に襲われた慎太を救うが、慎太は父親に託された陸軍資金に関する機密文書を持っていた。